但需要缴纳保证金给公司，是否合法？

不合法。公司向员工收取保证金违反了《劳动合同法》规定，用人单位不得以任何形式收取劳动者保证金。如公司强制要求，员工有权拒绝并可向劳动监察部门投诉。不及时处理可能导致员工权益持续受损，甚至面临法律纠纷。
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常见的处理方式有：拒绝缴纳并协商、向劳动监察部门举报、寻求法律援助。面对公司的不合理要求，员工应首先尝试与公司协商；协商无果后，可向当地劳动监察大队举报；若遭遇威胁或侵害，应及时寻求律师帮助。
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处理方式如下：1.尝试与公司沟通，明确拒绝非法保证金要求，并表达法律后果的担忧。2.如公司坚持，可向劳动监察部门提交证据举报，由其介入调查处理。3.若个人权益已受损，应收集证据，咨询律师，通过法律途径维权。